谷歌 DeepMind 推出 AlphaGenome Atlas,覆盖人类基因组全部 90 亿种单核苷酸变异预测
谷歌旗下DeepMind于9月8日推出AlphaGenome Atlas平台,涵盖人类基因组中全部90亿种单核苷酸变异的功能预测,是目前最全面的基因突变分子生物学影响目录,学术研究可免费使用。该平台基于其AI模型AlphaGenome的大规模预计算,绘制全基因组DNA变异分子效应图谱,并整合AlphaMissense模型优势,发布AVI评分,将变异影响浓缩为单一数值,便于研究人员排序与解读,该评分同时适用于编码区与非编码区。AlphaGenome Atlas数据集规模达1PB,包含数千种分子效应预测、AVI特征归因及超2500个DNA序列基序。实测中,博德研究所团队借助AVI评分发现与癫痫性脑病相关的DNM1基因变异;埃克塞特大学团队则多发现22%的非编码基因关联。该平台即日起通过门户网站及API向学术开放,非商业研究免费,后续将开放商业使用权限。
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